Mario a commencer à jouer au Hockey très tôt et rejoint les Hurricanes de Montréal en ligue junior. À 15 ans, il est le premier joueur choisi au repêchage de la ligue Midget pour jouer avec les Voisins de Laval de la Ligue Junior Majeur du Québec.
Il a recu le trophée Michel Brière, le joueur le plus utile de la saison, le trophée Jean Béliveau pour le plus grand nombre de points, le Trophée Guy Lafleur du joueur le plus utile des Séries et aussi le trophée Michael Bossy pour le plus grand espoit de la Ligue Junior Majeur du Québec.
Son numéro:
Au moment de débuter sa carrière professionnelle, Lemieux s'est posé la question de savoir quel numéro il allait porter.
Ses agents de l'époque étaient également les agents de Wayne Gretzky, célèbre joueur au numéro 99. Ils lui ont alors suggéré d'abandonner le 27 qu'il portait, en l'honneur de son grand frère Alain, pour prendre le 66 à la fois semblable au 99 de Gretzky tout en étant différent. Il joue sa dernière saison dans la LHJMQ avec le 66.